Los orígenes del Colegio Mayor San Gregorio se remontan al siglo XVI, en concreto al año 1534. Se ubicaba entonces en la esquina de las calles San Francisco y Mendizábal, frente al Edificio Histórico de la Universidad.
El edificio actual se emplaza en el Campus de Los Catalanes. Se trata de un inmueble de adscripción historicista y obedece al proyecto de los hermanos Francisco y Federico Somolinos (1942). Destaca la potencia de su portada cuyo tímpano rompe la línea de cornisa y que supone un marco para el escudo del Colegio San Gregorio. Fue rehabilitado en 1991 por el arquitecto Nicolás Arganza para dotarlo de todas las comodidades.